博人傳劇情接入正軌，各路人馬紛紛開始拋頭露面，其中有一位可謂是經典的角色，那就是蛇叔大蛇丸。眾人皆忍戰，唯我搞科研。大蛇丸的一生不是搞科研，就是在搞科研的路上，禁術、不死之術、穢土轉生、克隆技術、咒印等等都曾經是大蛇丸的科研項目。而在目前播出的動漫中，大蛇丸的出場次數少之又少，雖然不是主要人物，但是依舊到處都是他的影子。
首先是巳月，巳月是大蛇丸研究仙人體的複製人，天生擁有仙人體質。和大蛇丸一樣擁有陰暗的性格，在博人的影響下，逐漸陽光起來。天生的優勢使他能夠開啟仙人模式，不過代價是身體負擔太大，不能多次使用，除非緊急情況。那麼大蛇丸培育巳月是為什麼呢？
從正常的邏輯來看，博人傳中鳴人曾經提到過和大蛇丸是合作關係，大蛇丸提供科學研究，鳴人安排好巳月來木葉上學，看得出大蛇丸對巳月是真的關愛。
不過，大蛇丸克隆出巳月的目的可能不只是為了研究柱間細胞和仙人體。而大蛇丸最初的目的是得到一副完美的身體和寫輪眼，所以單純地去說蛇叔是真的把巳月當作孩子行不通，克隆出來的目的就是為了某項研究。已知的是巳月可以仙人化，但並不完美，所以大膽猜測下，大蛇丸的目的依舊是找一個容器，轉生後可以得到更強大的力量，只是還在研究中。
在第175集的動畫裡，大蛇丸幫助木葉擊敗了維克多，解決了神樹的問題，那麼大蛇丸出現在這裡的目的又是什麼呢？只是送巳月來幫助解決危機嗎？看似是這樣，不過大蛇丸真正的目的應該是殼組織引起了他的興趣，或者說是殼組織中的某樣研究、某些東西引起了他的興趣。總而言之，大蛇丸看似不戀凡塵的外表下肯定隱藏了很多不為人知的秘密。
